B[FM]²: Brain Foundation Model via Flow Matching with SplitUNet
Jaedong Hwang, Kathleen Zhang, David Dai, Konstantinos Kontras, Maarten De Vos, Ila Fiete, Paul Liang
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OVERVIEW
论文概览
绕过 patch 和离散 token,以连续时间流匹配直接预训练原始 EEG,并分别建模时间与电极轴。
ABSTRACT
中文摘要
EEG 基础模型能够从大规模 EEG 语料学习可泛化表征,使单一主干迁移到不同临床和脑机接口任务。现有模型通常将连续多通道 EEG 波形离散化为 patch 或码本 token,再以掩码自监督训练 Transformer。认识到这种离散化会割裂连续脑节律、掩盖精细时间动力学,我们提出 B[FM]²,即通过流匹配构建的脑基础模型。该模型放弃离散化,使用连续时间流匹配直接在原始信号上预训练,不采用 patch、token 化或掩码。然而,多通道 EEG 给流匹配带来架构挑战:时间轴采样密集且高度自相关,包含数千时间点;电极轴则很短,只有分布于不同头皮位置的数十通道。为解决时间—电极不对称性,我们提出速度网络 SplitUNet,把每个模块分解为独立的一维时间卷积和一维电极卷积,并只沿时间降采样,在整个层级中保留电极拓扑。B[FM]² 在九项标准 EEG 下游分类任务中的七项取得最先进表现,预训练仅使用 36,895 个片段,约 307 小时,相当于现有 EEG 基础模型所需预算的约 3.3%。它还生成两名具备专科认证的神经科医生无法与真实 EEG 区分的合成 EEG,Cohen's κ 为 −0.096。
RESEARCH RELEVANCE
与你研究的关系
论文事实:原始信号流匹配与时间/电极分解架构,在较小预训练预算下支持多任务迁移与 EEG 生成。研究推断:统一编解码模型可比较连续潜变量生成和离散 token 重建对节律、语义信息及缺失区域恢复的影响。
LIMITATIONS
局限与核查重点
主要证据来自分类与波形生成,尚未证明开放视觉/语言解码。两位医生的真伪判断及负 κ 不能独立证明生理真实性或下游有效性;预训练预算比例需结合各基线的数据与训练设置理解。
SOURCE
来源与原文
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Jaedong Hwang, Kathleen Zhang, David Dai, Konstantinos Kontras, Maarten De Vos, Ila Fiete, Paul Liang. B[FM]²: Brain Foundation Model via Flow Matching with SplitUNet. NeurIPS 2026 已录用 Poster · 官方会议页面. https://neurips.cc/virtual/2026/poster/148190